Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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