Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MICAQ29983 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms