Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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