Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF239Q16600 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF239Q16600 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF239Q16600 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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ZNF239Q16600 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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ZNF239Q16600 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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ZNF239Q16600 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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