Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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