Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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