Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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SS18Q15532 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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SS18Q15532 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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SS18Q15532 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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SS18Q15532 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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SS18Q15532 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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SS18Q15532 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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SS18Q15532 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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