Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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