Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms