Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FHL3Q13643 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FHL3Q13643 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FHL3Q13643 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FHL3Q13643 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FHL3Q13643 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms