Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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