Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms