Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OC90Q02509 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OC90Q02509 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OC90Q02509 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OC90Q02509 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OC90Q02509 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OC90Q02509 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms