Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms