Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SIM1P81133 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms