Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JAG1P78504 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
JAG1P78504 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JAG1P78504 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
JAG1P78504 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
JAG1P78504 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
JAG1P78504 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
JAG1P78504 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JAG1P78504 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JAG1P78504 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms