Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms