Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF3P61204 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms