Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms