Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms