Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ETFBP38117 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ETFBP38117 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms