Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA1P25391 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms