Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTPRGP23470 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRGP23470 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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