Protein–RNA interactions for Protein: P21453

S1PR1, Sphingosine 1-phosphate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR1P21453 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR1P21453 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms