Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGF3P11487 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FGF3P11487 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms