Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms