Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL3P10147 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3P10147 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms