Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI4P10075 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI4P10075 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI4P10075 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GLI4P10075 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GLI4P10075 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GLI4P10075 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GLI4P10075 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GLI4P10075 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GLI4P10075 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GLI4P10075 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms