Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms