Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB1P08034 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB1P08034 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB1P08034 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB1P08034 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB1P08034 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB1P08034 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms