Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVILO95425 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVILO95425 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVILO95425 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SVILO95425 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms