Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms