Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRICKLE3O43900 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms