Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCAO15360 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCAO15360 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms