Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TO15178 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TO15178 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TO15178 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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