Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms