Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP1Q9UPQ3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms