Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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