Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH3Q9UHC1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms