Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms