Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSFQ9UBX1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms