Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms