Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC28Q9NX36 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC28Q9NX36 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms