Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCIQ9NVI1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCIQ9NVI1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCIQ9NVI1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCIQ9NVI1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCIQ9NVI1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCIQ9NVI1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms