Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC22A11Q9NSA0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms