Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms