Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPAG4Q9NPE6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms