Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM60AQ9NP50 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms