Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms