Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCSER1Q9C0I3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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